原因としては、以下のことが考えられます。
1) サンプルプラグが歪んだ状態で泳動ゲルのウェルに入っている。
プラグの上面と泳動ゲルの上面が平行になるようにプラグを入れるようにしてください。
2) 泳動ゲルのウェルが歪んでいる。
ゲル作成時やコームを抜く時にウェルの形が歪んだ場合には、再度作成しなおしてください。
3) ポンプの流速が弱い。
流路のチューブが途中でつぶれていないかどうかを確認してください。ポンプそのものの流速が遅くなっていることもあるので、ポンプの流速を上げてみてください。
4) 液体サンプルでウェルの上部にアプライしている。
ウェルの上部側にアプライしていると、歪んだバンドとなります。ウェルの底から50%までの高さまでに液体サンプルをアプライするようにしてください。