[Quantity One] Windows版とMacintosh版でデータの互換性はありますか?

互換性があります。

ただしOSの問題でファイル名に使える文字数の制限があったり、拡張子が正しく認識されない場合があります。
いずれの場合も、正しい処理を行えばデータは互換可能です。

例えば、WindowsのデータをMacintosh OS X　で開く場合は対象のファイルの種類を　Loadble files から　All files に変更することで互換することができます。