[ハイドロテックバキュームポンプ] Instruction Manual(Rev. D)のAppendix B（10ページ）に記載されている、Vacuumの値をinchHgからTorrにすると換算すると値が合わないのですが、どちらが正しいのですか？

マニュアルの記載ミスです。正しくは次のようになります。

Vacuum
Starting >29 inchHg (737 Torr or 97.9 kPa)
After 10 hr >28 inchHg (711 Torr or 94.5 kPa)
At 35 C RT >26 inchHg (660 Torr or 87.8 kPa)

圧力単位に換算するときは、次の数値を参考にしてください。
1 inchHg＝
0.4912 psi
3.376 kPa
25.4 Torr
0.03376 Bar
0.0345 kg/cm2