パルスフィールド電気泳動 全般に関する質問集

質問 ID: 3225

[CHEF-DRシリーズ] バクテリアのパルスフィールド電気泳動で、サンプルのバンドがスメアになってしまいます。サイズスタンダード(マーカー)のバンドはスメアになっていません。

回答

ウェルに残存するDNAがほとんどなく、サンプルバンドのみがスメアになっている場合、プラグ調製時や保管時にDNaseが混入している可能性が考えられます。

プラグの再調製が必要です。
また溶菌現象が起きている可能性もありますので、溶菌しやすい菌の場合培養時間の検討が必要になります。