[T100] Tools>Settingsで表示される画面にあるEnd of run beepにチェックを入れていて、プロトコールの最後ステップがHoldの場合、ビープ音はどういうタイミングで鳴りますか？

End of run beepにチェックをつけていると、プロトコール内のHoldステップで、Holdステップの設定温度にほぼ達した時（1℃手前）にビープ音がなります。

もし途中のステップにHoldが入っていた場合には、そのHoldステップでもビープ音が鳴ります。
なおHoldステップが入っていないプロトコールの場合には、完全にプロトコールが終了した時にビープ音が鳴ります。