可能です。
SetupページでOptionsをクリックして、出てくる項目でExport Amplitude and Cluster Dataをクリックすると、出力されるフォルダを指定する画面が出てきます。フォルダを選ぶと、そこのフォルダにテキストファイルが入っています。１つのウェルあたり１つのテキストファイルで出力され、Assay 1とAssay 2の蛍光値（Amplitude）がカンマ区切りで記載されています。１行が１ドロップレットということになります。
Amplitudeの横にはcluster項目があり、1～4の番号が割り振られています。これはそのドロップレットがどのclusterに属するかを示しています。
cluster項目の番号は以下を示します。
1: FAM (-), HEX/VIC (-)
2: FAM (+), HEX/VIC (-)
3: FAM (+), HEX/VIC (+)
4: FAM (-), HEX/VIC (+)